Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PMCHL1Q16048 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL1Q16048 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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