Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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ZFHX3Q15911 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ZFHX3Q15911 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ZFHX3Q15911 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZFHX3Q15911 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZFHX3Q15911 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms