Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIV2LQ15477 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms