Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTF1Q15361 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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