Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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PRKD1Q15139 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PRKD1Q15139 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKD1Q15139 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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PRKD1Q15139 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PRKD1Q15139 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKD1Q15139 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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