Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms