Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMCO1Q147U7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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