Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPARCL1Q14515 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms