Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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