Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A3Q14050 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A3Q14050 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
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