Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms