Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GTF2H2Q13888 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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