Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ITGA9Q13797 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms