Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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