Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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