Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE3BQ13370 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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