Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SP140Q13342 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SP140Q13342 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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