Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDRQ13258 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDRQ13258 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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