Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAF1AQ13111 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAF1AQ13111 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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