Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN3Q13064 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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