Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRJQ12913 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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