Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPTFQ12830 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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