Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB40BQ12829 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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RAB40BQ12829 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB40BQ12829 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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