Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXO1Q12778 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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