Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGXB3Q12766 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
HMGXB3Q12766 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGXB3Q12766 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
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