Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 SRL3YKR091W 741 nt4.64□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 SAR1YPL218W 573 nt4.64□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 GMC1YDR506C 1827 nt4.64□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 HMG1YML075C 3165 nt4.64□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 SKG6YHR149C 2205 nt4.64□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 YGR250CYGR250C 2346 nt4.63□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 SSE1YPL106C 2082 nt4.63□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 UBP5YER144C 2418 nt4.63□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 YDL041WYDL041W 354 nt4.63□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 PAN1YIR006C 4443 nt4.63□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 SWI3YJL176C 2478 nt4.63□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 HOS3YPL116W 2094 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 YDR426CYDR426C 378 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 RPS18BYML026C 441 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 CSE2YNR010W 450 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 GIP4YAL031C 2283 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 TOF2YKR010C 2316 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 OSH2YDL019C 3852 nt4.62□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 PEX8YGR077C 1770 nt4.61□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 RPL23AYBL087C 414 nt4.61□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 CDC45YLR103C 1953 nt4.6□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 SEA4YBL104C 3117 nt4.6□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 GCN20YFR009W 2259 nt4.6□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 SNU13YEL026W 381 nt4.6□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 YOR376WYOR376W 369 nt4.6□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 PRP42YDR235W 1635 nt4.6□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 YMR102CYMR102C 2505 nt4.6□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 VID22YLR373C 2706 nt4.59□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt4.59□□□□□ -1.67
TFB4Q12004 CRT10YOL063C 2874 nt4.59□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 PDC2YDR081C 2778 nt4.59□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 ADP1YCR011C 3150 nt4.58□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 ISM1YPL040C 3009 nt4.58□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 CDC24YAL041W 2565 nt4.58□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 NPC2YDL046W 522 nt4.58□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 PFK26YIL107C 2484 nt4.58□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 MPS1YDL028C 2295 nt4.58□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YIL166CYIL166C 1629 nt4.57□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 LYS2YBR115C 4179 nt4.57□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.57□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt4.57□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.57□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 JHD2YJR119C 2187 nt4.57□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 NUP82YJL061W 2142 nt4.57□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 TRZ1YKR079C 2517 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 FUN12YAL035W 3009 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 KIC1YHR102W 3243 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 GPI1YGR216C 1830 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 GYP7YDL234C 2241 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 NRP1YDL167C 2160 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YGL239CYGL239C 315 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 MDM20YOL076W 2391 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 HDA3YPR179C 1968 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 NAT1YDL040C 2565 nt4.56□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 UPC2YDR213W 2742 nt4.55□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 INA22YIR024C 651 nt4.55□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 DLS1YJL065C 504 nt4.55□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 APC9YLR102C 798 nt4.55□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 GOT1YMR292W 417 nt4.55□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 FAA2YER015W 2235 nt4.55□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 IMH1YLR309C 2736 nt4.55□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 snR79snR79 84 nt4.54□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 TRM2YKR056W 1920 nt4.54□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YHR210CYHR210C 1026 nt4.53□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YML037CYML037C 1023 nt4.53□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt4.53□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 YPK1YKL126W 2043 nt4.53□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 ECM16YMR128W 3804 nt4.53□□□□□ -1.68
TFB4Q12004 VID28YIL017C 2766 nt4.52□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 NUP133YKR082W 3474 nt4.52□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YPR146CYPR146C 330 nt4.52□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 ACE2YLR131C 2313 nt4.52□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 PDE2YOR360C 1581 nt4.52□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 TCO89YPL180W 2400 nt4.52□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 GRS2YPR081C 1857 nt4.52□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 PUF6YDR496C 1971 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 MRPL33YMR286W 261 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 SWA2YDR320C 2007 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 AIM21YIR003W 2040 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 SEC5YDR166C 2916 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 RAD1YPL022W 3303 nt4.51□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 IOC3YFR013W 2364 nt4.5□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 TFB1YDR311W 1929 nt4.5□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YEL045CYEL045C 426 nt4.5□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YLR012CYLR012C 300 nt4.5□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 RAD54YGL163C 2697 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 ROD1YOR018W 2514 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YGR237CYGR237C 2358 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 LCD1YDR499W 2244 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 SEN1YLR430W 6696 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 UPS1YLR193C 528 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 KEL2YGR238C 2649 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 RED1YLR263W 2484 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 CDH1YGL003C 1701 nt4.49□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 TCP1YDR212W 1680 nt4.48□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YIL058WYIL058W 285 nt4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.5 ms