Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CGNL1Q0VF96 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms