Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms