Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC9Q06265 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms