Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 PRE8YML092C 753 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 YNL122CYNL122C 348 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 GAL7YBR018C 1101 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 RPS12YOR369C 432 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 SGS1YMR190C 4344 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 YNL034WYNL034W 1839 nt2.61□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 VAC8YEL013W 1737 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 YCR064CYCR064C 411 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 RAD6YGL058W 519 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 AIM32YML050W 936 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 CAT5YOR125C 702 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 TOA1YOR194C 861 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 SVS1YPL163C 783 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 SUL1YBR294W 2580 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 NFT1YKR103W 3657 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 MSB1YOR188W 3414 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 SHE9YDR393W 1371 nt2.6□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 YDR239CYDR239C 2364 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 ISW1YBR245C 3390 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 LAG1YHL003C 1236 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 TIM10YHR005C-A 282 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 GPI14YJR013W 1212 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 COQ10YOL008W 624 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 ATP19YOL077W-A 207 nt2.59□□□□□ -1.99
VPS38Q05919 PSK2YOL045W 3306 nt2.59□□□□□ -2
VPS38Q05919 BAS1YKR099W 2436 nt2.58□□□□□ -2
VPS38Q05919 SPC1YJR010C-A 285 nt2.58□□□□□ -2
VPS38Q05919 YPL080CYPL080C 327 nt2.58□□□□□ -2
VPS38Q05919 OSW7YFR039C 1533 nt2.58□□□□□ -2
VPS38Q05919 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YER138CYER138C 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YER160CYER160C 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YJR027WYJR027W 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YML039WYML039W 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YML045WYML045W 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YMR050CYMR050C 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 SLN1YIL147C 3663 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 SDC25YLL016W 3147 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 RPL9AYGL147C 576 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 YGR045CYGR045C 363 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 PEX4YGR133W 552 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 MRPL44YMR225C 297 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 PET123YOR158W 957 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 PSO2YMR137C 1986 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 ECM5YMR176W 4236 nt2.57□□□□□ -2
VPS38Q05919 TOP2YNL088W 4287 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 SCD5YOR329C 2619 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 LEU3YLR451W 2661 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 ECM25YJL201W 1800 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 TRA1YHR099W 11235 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 YDR220CYDR220C 294 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 RNP1YLL046C 750 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 RPL36AYMR194W 303 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 YOL134CYOL134C 390 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 YEF3YLR249W 3135 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 SNX41YDR425W 1878 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 DNA2YHR164C 4569 nt2.56□□□□□ -2
VPS38Q05919 YBT1YLL048C 4986 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 YCR108CYCR108C 192 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 RTR2YDR066C 591 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 CRS5YOR031W 210 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 RGL1YPL066W 1440 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 TRM7YBR061C 933 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 ACM1YPL267W 630 nt2.55□□□□□ -2
VPS38Q05919 SMY2YBR172C 2223 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 YKU80YMR106C 1890 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 NDD1YOR372C 1665 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 PDR11YIL013C 4236 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 RPL16AYIL133C 600 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 YJR023CYJR023C 402 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 VPH2YKL119C 648 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 EMC6YLL014W 327 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 DPB11YJL090C 2295 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 RGA2YDR379W 3030 nt2.54□□□□□ -2
VPS38Q05919 YOL098CYOL098C 3114 nt2.53□□□□□ -2
VPS38Q05919 TMN3YER113C 2121 nt2.53□□□□□ -2
VPS38Q05919 SGM1YJR134C 2124 nt2.53□□□□□ -2
VPS38Q05919 SSE1YPL106C 2082 nt2.53□□□□□ -2
VPS38Q05919 TPM2YIL138C 486 nt2.53□□□□□ -2
VPS38Q05919 CMS1YLR003C 876 nt2.53□□□□□ -2
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