Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms