Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 SLU7YDR088C 1149 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RSM18YER050C 417 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 LOC1YFR001W 615 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YDR338CYDR338C 2088 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 NPR1YNL183C 2373 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YPR089WYPR089W 2667 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 DIS3YOL021C 3006 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 TRZ1YKR079C 2517 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 STH1YIL126W 4080 nt2.17□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 PSK2YOL045W 3306 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 MFB1YDR219C 1398 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RSM28YDR494W 1086 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 LIN1YHR156C 1023 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RCN1YKL159C 636 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 ARL1YBR164C 552 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 MBA1YBR185C 837 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 VPS16YPL045W 2397 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 VPS34YLR240W 2628 nt2.16□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 ELG1YOR144C 2376 nt2.15□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YIP1YGR172C 747 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 FYV4YHR059W 393 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YET1YKL065C 621 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YLR255CYLR255C 354 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 PEP12YOR036W 867 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 ADF1YCL058W-A 342 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 CDC37YDR168W 1521 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 LST4YKL176C 2487 nt2.15□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YCR108CYCR108C 192 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 PRE4YFR050C 801 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 PCL5YHR071W 690 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YLR224WYLR224W 1110 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YBR051WYBR051W 351 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 IST2YBR086C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 MSL5YLR116W 1431 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 SNU114YKL173W 3027 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 FAB1YFR019W 6837 nt2.14□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 REF2YDR195W 1602 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 STI1YOR027W 1770 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YCR090CYCR090C 549 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YDL163WYDL163W 303 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 RPS17BYDR447C 411 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YGL109WYGL109W 324 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YNL235CYNL235C 432 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 SUS1YBR111W-A 291 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 DAL5YJR152W 1632 nt2.13□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 SSF2YDR312W 1362 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YDR248CYDR248C 582 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 PGD1YGL025C 1194 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 AIM18YHR198C 966 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 NBP1YLR457C 960 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 IGO1YNL157W 507 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YOR152CYOR152C 771 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 TAZ1YPR140W 1146 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YCL002CYCL002C 792 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YRR1YOR162C 2433 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 APM3YBR288C 1452 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 UBR1YGR184C 5853 nt2.12□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YCR099CYCR099C 468 nt2.11□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.11□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 RMP1YLR145W 606 nt2.11□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.11□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 GIP3YPL137C 3831 nt2.11□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 RTP1YMR185W 2946 nt2.11□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 NTF2YER009W 378 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 SNO3YFL060C 669 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 MIC19YFR011C 513 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 MND1YGL183C 660 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YKL123WYKL123W 381 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 VTI1YMR197C 654 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 SNO2YNL334C 669 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YBR277CYBR277C 402 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 PRK1YIL095W 2433 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 CFT1YDR301W 4074 nt2.1□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YDR042CYDR042C 603 nt2.09□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 YJL119CYJL119C 324 nt2.09□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 SDS22YKL193C 1017 nt2.09□□□□□ -2.07
CSI1Q04368 NCS2YNL119W 1482 nt2.08□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YDR115WYDR115W 318 nt2.08□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 TAD1YGL243W 1203 nt2.08□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 THG1YGR024C 714 nt2.08□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.08□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 MES1YGR264C 2256 nt2.08□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 UBX3YDL091C 1368 nt2.08□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 PES4YFR023W 1836 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 PSO2YMR137C 1986 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 COS111YBR203W 2775 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 PCK1YKR097W 1650 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 snR5snR5 204 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 PBP4YDL053C 558 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YMR254CYMR254C 309 nt2.07□□□□□ -2.08
CSI1Q04368 YNL303WYNL303W 348 nt2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms