Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF85Q03923 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF85Q03923 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms