Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms