Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF8Q02556 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.9 ms