Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDR2Q01850 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms