Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms