Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN7AQ01118 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms