Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms