Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED6P86452 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED6P86452 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms