Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKOR1P84550 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms