Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBX1P83916 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX1P83916 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX1P83916 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms