Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN10P78369 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms