Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms