Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX1P78337 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX1P78337 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX1P78337 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms