Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HBBP68871 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBBP68871 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBBP68871 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBBP68871 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBBP68871 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBBP68871 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms