Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB11AP62491 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms