Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms