Protein–RNA interactions for Protein: P59797

SELENOV, Selenoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOVP59797 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SELENOVP59797 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SELENOVP59797 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SELENOVP59797 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SELENOVP59797 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SELENOVP59797 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms