Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC13P55735 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC13P55735 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC13P55735 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC13P55735 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC13P55735 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC13P55735 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC13P55735 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC13P55735 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms